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Die FHIR®-Spezifikation beinhaltet die technische Repräsentation des beschriebenen Informationsmodells. Dabei werden sowohl die einzelnen FHIR®-Profile sowie -Ressourcen im Abschnitt FHIR®-Ressourcen, Phase II spezifiziert als auch im Abschnitt Übergreifende FHIRFHIR®-Festlegungen, Phase II Festlegungen getroffen, die über Definition der einzelnen FHIR®-Ressourcen hinausgehend gelten.
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Einige Elemente der FHIR®-Spezifikation haben keine direkt korrespondierenden Elemente im Informationsmodell. Dazu zählen das CodeSystem, ValueSet und die ConceptMap, die für die Abbildung der Wertelisten aus dem Informationsmodell benötigt werden.